Fasta to GFA is een klein python script dat gebruikt wordt om Fasta bestanden te converteren naar GFA bestanden voor visualisatie in Bandage. Dit is alleen voor visualisatie, omdat er geen informatie over de coverage beschikbaar is uit een Fasta-bestand. Dit betekent ook dat er geen cirkelvormige fragmenten in deze GFA-bestanden zitten.
Dit kan worden gebruikt in gevallen zoals het polishen van geassembleerde derde generatie sequencing data met Medaka en Racon na een Flye assembly. Aangezien Medaka en Racon geen GFA output leveren, maar Flye wel.
Deze tool maakt het eenvoudig om deze gepolishte assemblies te visualiseren en de verschillende contigs weer te geven.
De tool is beschikbaar op onze github.
